Во время контролируемого процесса остановки системы через утилиту shutdown, программа init будет пытаться запустить скрипт /etc/rc.shutdown, после чего будет посылать всем процессам сигнал прекращения работы, и затем сигнал принудительного прекращения работы тем процессам, которые не завершили работу вовремя.